摩尔庄园肥肥馆的培育机制主要通过猪的配种与星级管理实现。当猪的头上出现心形标志时，表示已进入可培育状态，点击后选择配偶即可开始配种。不同星级的猪培育时，后代星级会取父母星级的中间值，例如1星与4星配对可能产生2星或5星后代。需除特种猪外，所有猪苗从背包直接放入肥肥馆时初始均为1星。培育过程中，母猪的品种决定了后代的品种，因此保留特定品种的母猪是延续血统的关键。
催产素是加速培育过程的重要道具，每次使用可缩短母猪怀孕时间12小时。每头猪单次培育周期仅能使用一次催产素，且每日零点重置使用次数。若需快速获得幼崽，可在零点前后各使用一次催产素实现即时生产。机械工坊可作为临时存放场所，其中猪只会停止生长但保留培育状态，适合用于管理过剩的种猪资源。铁屑加工铁锭的效率远高于矿石冶炼，每日通过打扫好友熔炉最多可获得4个铁屑，这是升级机械工坊材料的高效获取方式。
若玩家缺乏某品种的公猪，需添加拥有该品种的好友进行跨庄园配种。例如培育肥肥天使需先获得该品种公猪的协助。分馆中的绝世猪可产出帝企鹅等特殊生物，而系统会为无猪可养的好友自动提供哈利波波猪作为基础种源。星级越高的猪养殖成本越高，但高星级猪在参赛或出售时收益更显著，建议优先保留圣诞袜袜、彼得大帝等高性价比品种。
机械工坊的升级直接影响资源采集效率。初级工坊仅能开采铁矿石，中级工坊增加铜矿石，高级工坊则解锁金矿石。升级需消耗螺母、螺栓等材料，可通过好友指导生产功能每日获取额外金属锭。肥肥馆与机械工坊存在联动机制，分馆和工坊内的猪均会停止生长，这种设计便于玩家集中管理育种周期较长的优质种猪。
